Определяется формой, стадией, тяжестью заболевания, наличием осложнений, возрастом детей. Неблагоприятен при тотальном поражении кишечника, тяжелых осложнениях. Пациенты должны находиться под непрерывным диспансерным наблюдением, осматриваться не реже одного раза в месяц, а при рецидивирующем течении — чаще. В периоде диспансерного наблюдения важное значение придается режиму, санации очагов инфекции, своевременному и полноценному противорецидивному лечению.